隨著蛋白質(zhì)化學和分子生物學的發(fā)展，用于各種疾病治療的蛋白質(zhì)類藥物的研制和應(yīng)用已成為生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)發(fā)展的熱點。多肽和蛋白類藥物副作用小、活性強，并具有標本兼治的功效。當我們純化蛋白時，最重要的就是要保持蛋白在純化過程中不能失活，或者是盡量降低純化過程對蛋白活性帶來的損失。因此，在設(shè)計緩沖液時應(yīng)考慮以下幾個因素：pH值、緩沖體系、鹽離子、還原劑和穩(wěn)定劑。

pH值

很多實驗的pH值設(shè)定在7.4以模仿生物條件，但如果目的蛋白在此條件下不穩(wěn)定，就需要改變pH值使它在溶液中處于可溶且不會降解的狀態(tài)。當溶液pH值在蛋白等電點pI附近時，其在溶液中會表現(xiàn)得不易溶解，因為此時蛋白表面沒有凈電荷，從而容易聚集。可以用ExPASy網(wǎng)站的ProtParam工具快速簡便地計算蛋白等電點pI值，只要提交蛋白序列即可。

緩沖體系

首先我們要確保所選擇的緩沖體系在設(shè)定的pH值上確實具有緩沖能力，其解離常數(shù)pKa值應(yīng)該在所設(shè)定的pH值上下一個單位內(nèi)。

再者是確保緩沖液濃度足夠高以達到實際緩沖溶液的作用。一般會選擇的濃度是20~100mM。需要注意的是所使用的緩沖體系不能影響蛋白活性，比如磷酸鹽會抑制激酶的活性，所以反應(yīng)前應(yīng)*地透析掉。

此外，一些緩沖體系對溫度非常敏感，例如Tris-HCl緩沖液，如果在25℃時將緩沖體系調(diào)至pH值8，其pH值將在5℃時增加到8.58，在37℃時降到7.71，所以，如果不是在25℃下進行實驗，就應(yīng)該考慮到這個pH值可能在實驗條件中不適用。

鹽離子

許多緩沖液中含有NaCl，以幫助保持蛋白的可溶性和模擬生理條件，濃度一般為150mM，但在不同的蛋白純化步驟中，可能需要不同的鹽離子濃度。離子交換層析一般是低鹽結(jié)合、高鹽洗脫，結(jié)合時需要降低鹽濃度是為了避免高離子強度下，鹽離子與蛋白競爭與填料結(jié)合，防止蛋白從離子交換柱中流穿，從而使柱子能夠結(jié)合目的蛋白；而疏水層析一般為高鹽結(jié)合、低鹽洗脫。

還原劑

如果目標蛋白含有半胱氨酸殘基，可能會出現(xiàn)殘基間的氧化問題，并可能導致蛋白聚集。為了防止這一點，往往會在緩沖液中添加一些還原劑，如DTT、TCEP和巰基乙醇。

TCEP是這三個還原劑中z穩(wěn)定的，但也是最貴的。通常純化過程中的緩沖液里會添加DTT，在最后保存酶液的緩沖液里添加TCEP。還原劑濃度一般是5~10mM，它應(yīng)遠遠高于蛋白濃度。DTT和巰基乙醇在室溫下就會降解，所以需要將添加了還原劑的緩沖液處于低溫保藏，或者在使用時再添加還原劑。

使用還原劑時要確保柱材料能夠與之相容，比如高濃度的還原劑會脫掉鎳柱中的鎳，并使柱子顏色變深呈棕色，雖然鎳柱能進行再生，但柱載量將會受到很大影響。

穩(wěn)定劑

添加一些穩(wěn)定劑到緩沖液中，能幫助提高蛋白純化時的蛋白溶解度和穩(wěn)定性。在緩沖液中添加惰性蛋白BSA在某種程度上可以穩(wěn)定目標蛋白，但必須確保這些加入的穩(wěn)定劑不干擾實驗；有時添加甘油、聚乙二醇等以增加緩沖液粘度，有助于防止蛋白聚集；另外，使用少量的表面活性劑和一些離子化合物如硫酸鹽、氨基酸、檸檬酸等可以避免蛋白間的離子相互作用，幫助蛋白溶解。

 
以上就是在設(shè)計緩沖液時應(yīng)該考慮的五個因素，為了保持蛋白在純化過程中的活性和穩(wěn)定性，我們應(yīng)當設(shè)定最佳實驗方案。